Про храм13 июня 1999 года по благословению правящего Архиерея Высокопреосвященнейшего Никодима Митрополита Харьковского и Богодуховского в с.Станичное Нововодолажского района Харьковской области был совершон чин освящения креста и заложение камня под строительство храма в честь Святого Иоанна Хрестителя. Чин совершил настоятель Свято-Николаевского храма пос.Жихоря. Секретарь Харьковской Епархии прот. Роман Водяний.
Строительство храма велось на средства Станичанского колхоза имени Дзержинского под руководством председателя колхоза Кукленко Владимира Тимофеевича.
Строительство храма завершилось в 2000 году.
15 октября 2000 года по благословению Высокопреосвященнейшего Никодима Митрополита Харьковского и Богодуховского Викарий Харьковской Епархии Высокопреосвященнейший Онуфрий Епископ Изюмский в сослужении священства и мирян совершил чин освящения храма и престола и совершил первую Архиерейскую службу.
Настоятелем храма был назначен иерей Александр Неронов.
С 25 ноября 2008 года настоятелем храма был назначен иерей Василий Гордиевич.
Сейчас в храме ведутся работы по строительству новой колокольни.
В 2010 г. закончено строительство колокольни.
7 сентября 2010 г. освящен поклонный крест.